מבנה ישיבת מיר במודיעין עילית הוא קמפוס ל-2,000 תלמידים, נבנה בשלבים. השלב הראשון , בשטח של כ-12,000 מ”ר , כלל בתוכו בית מדרש ל-800 איש המשמש גם כבית כנסת, כיתות לימוד, חדרי מנהלה, פנימייה ל-620 מיטות, מטבח מקצועי וחדר אוכל לבאי הישיבה. השלב השני כלל כולל בשטח של 2,000 מ”ר, וחדרי פנימייה נוספים בשטח של 6,000 מ”ר. בשלב הסופי הקמפוס ישתרע על שטח בנוי של 24,000 מ”ר בו יורחב בית המדרש , יתווספו כיתות לימוד וחדרי פנמיה .